Cây ăn quả chủ lực trồng tập trung ở Nam Bộ được Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn phê duyệt, trong đó 12 loại cây ăn trái chủ lực được đề nghị bao gồm thanh long, xoài, chôm chôm, sầu riêng, vú sữa, bưởi, nhãn, chuối, dứa (khóm), cam, mãng cầu và quýt. Hướng nghiên cứu xây dựng cơ sở dữ liệu bộ gen (genome) và DNA mã vạch (DNA barcode) đang được nhiều quốc gia, nhiều nhà khoa học trên thế giới rất quan tâm phát triển, đặc biệt trong những năm gần đây và sẽ là một xu thế nghiên cứu trong thời gian tới. Cơ sở dữ liệu này nhằm cung cấp thông tin về trình tự bộ gen và DNA mã vạch của một số giống cây ăn trái đặc sản khu vực Nam Bộ bao gồm sầu riêng, vú sữa và bưởi da xanh. Đây là nguồn dữ liệu phân tử hữu ích trong các nghiên cứu về đa dạng di truyền thực vật, hỗ trợ hiệu quả trong nghiên cứu về đa dạng di truyền, truy xuất nguồn gốc, giám định cây giống. Bên cạnh đó, các biến dị được phát hiện từ các gen chức năng trong bộ gen đóng vai trò quan trọng trong công tác lai tạo, đánh giá tiềm năng di truyền của cây trồng, phát triển các dấu phân tử DNA. Từ đó, các nhà khoa học có thể đưa ra quyết định lai tạo chính xác, tiết kiệm được thời gian và công sức, khắc phục được những hạn chế của phương pháp truyền thống, vốn dựa vào những chỉ tiêu hình thái, sinh lý.